农科教结合最初萌芽于农村教育改革的实践1983年8月，安徽省蒙城县为了发展农村职业技术教育，提出了“党政群齐抓共管，政科教多位一体”（后将“政科教多位一体”改为“农科教多位一体”），大力开发农村智力资源的口号，并成立了由县委、县政府领导牵头，农、科、教有关部门负责人参加的“开发农村科技人才领导小组”，下设办公室，从农、科、教三家抽人办公。同年，安徽省休宁县成立了县经济教育协调领导组，组织县农、科、教等部门联合办学，培养农业技术人才。1987年上半年，安徽省政制定了《关于大力发展农村职业技术教育的决定（试行）》，提出“农村职业技术教育由政府统筹规划，努力建立以职业学校为依托，农科教多位一体，普教与职教相互沟通，职前与职后相互衔接，县、区、乡分级办学的体制”，要求在沿淮行蓄洪区、大别山区以及“陶行知教育思想研究和农村教育改革徽州实验区”（今黄山市）大面积试行，并把这项工作列为下半年的十件实事之一。当时的徽州地委、行署明确提出“科教结合，为农服务”，并在休宁县溪口区进行实验。溪口区成立了“农科教协会”，组织区农、科、教部门以溪口职业中学为依托，联合办学，培养人才，推广科技，促进了全区经济迅速发展。1988年11月，安徽省委、省政府总结溪口实行农科教多位一体、大力发展农村职业技术教育的经验，决定在全省加快推广。1989年1月，国家教委副主任王明达致信安徽省政府负责同志，认为安徽省农科教多位一体的实验，“是一项很有意义的改革”，“安徽带了头走到了最前面”，并且提出，“多位一体容易被误解为要撤并机构，把农科教三个部门变成一个部门，在全国宣传，易引起顾虑，增加改革的阻力”。为此，王明达建议把“农科教多位一体”改为“农科教统筹或结合”。这一建议很快被安徽省委、省政府采纳。自此，便有了“农科教统筹”、“农科教结合”的提法。
在安徽省蒙城县、休宁县进行农科教统筹结合探索的时候，全国还有一批地区也开展着同样的实践活动。但在当时，可以说也还是一种局部的、分散的、简单自发的行为。它首先在农村教育体制改革中产生，由教育部门与农业、科技部门联合兴办农村职业技术教育和成人教育，进而扩展到农、科、教三者联合进行科技开发和经济开发。这时的农科教结合，着重点在于三大系统内部各自解决自身的统筹问题（如教育系统内部重点解决普通教育、职业技术教育、成人教育的“三教统筹”；科技系统着重解决基础研究、应用研究和开发研究的“三研结合”；农业系统内部则重点解决农业科研、农村教育、农技推广的“三农结合”），三大系统之间的协作，也多局限于农业与科技或农业与教育的结合。
随着农科教结合的探索不断深入，农、科、教三大系统逐步认识到仅仅解决本系统自身的统筹问题是不够的，必须农科教三者紧密结合起来，才有可能充分发挥科技、教育推动农村经济发展的巨大威力。1988年底，国家农、科、教几个部门开始酝酿农科教结合工作。1989年，中共中央提出“科教兴农”方针后，农业部、国家教委、国家科委、林业部、中国农业银行帐号等单位、在总结各地经验的基础上，于同年8月成立了全国农科教统筹与协调指导小组，下设办公室（设在农业部教育司），并联合下发了《关于农科教结合，共同促进农村、林区人才开发与技术进步的意见（试行）》，要求各地可选择一些有条件的县搞好农科教结合试点，积累经验，逐步铺开。1990年5月，全国农科教统筹与协调指导小组在安徽省滁县地区（今滁州市）召开了由14个省、市参加的“部分省市农科教结合工作座谈会”，总结各地经验，在全国部置试点工作。自此，农科教结合便由原来那种单项的体制改革，推向了教育体制、科技体制与农村经济发展有机结合的农村整体改革的新阶段，逐步走上了有领导、有步骤的发展轨道。
农科教结合工作的开展及其产生的影响和作用，引起了党中央、国务院的高度重视。1992年1月，经国务院批准，国务院办公厅、国务院研究室召开了全国农科教结合座谈会，国务院副总理田纪云，国务委员李铁映、宋健、陈俊生等领导同志作了重要讲话。随后，国务院下发了《关于积极实行农科教结合，推动农村经济发展的通知》，对农科教结合的内涵、实施农科教结合的必要性、当前的重要任务以及如何实施农科教结合等一系列问题作了完整系统的阐述和规定。从此，农科教结合在全国广泛开展。为了加强对全国农科教结合的宏观指导，1994年2月16日，李岚清副总理召集有关部门领导同志专门研究农科教结合工作，进一步提出把农科教结合作为极为重要的方针和发展农村经济的一个关键措施来抓，并决定将原五部委（行）组成的“全国农科教统筹与协调指导小组”更名为“全国农科教结合协调领导小组”，由农业部、国家科委、国家教委、国家计委、财政部、人事部、林业部、中国农业银行、国务院扶贫办等九单位组成（后增补水利部为领导小组成员单位）。1995年10月，经国务院同意，全国农科教结合协调领导小组在北京召开“全国农科教结合工作经验交流会”，李岚清副总理作了重要讲话；翌年12月，全国农科教结合协调领导小组又在福建省三明市召开“全国农科教结合示范区现场经验交流会，李岚清副总理给大会发了贺信。这两次会议分析了全国农科教结合工作的形势，总结了我国农科教结合的经验，明确了在社会主义市场经济条件下推行农科教结合的领导思想和发展方针，部署了”九五“时期的农科教结合工作，有力地促进了全国农科教结合工作蓬勃发展。在这一阶段，农科教结合的地位和作用得到充分肯定，实行农科教结合已作为科教兴农的一条根本性战略措施来要求，国家加强了对农科教结合工作的宏观指导，三结合的形式上升到宏观政府行为和微观市场行为有机结合的方式，呈现出多部门结合、多形式展开、全方位推进、深层次发展的基本格局。
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